O Parque Nacional de Anavilhanas desenvolve diversas ações e atividades:
As ações de rotina e atendimento de denúncias, bem como as operações de fiscalização, são realizadas com frequência mediana. No entanto, para atender satisfatoriamente às demandas de proteção do parque, está no rol das necessidades um posto de fiscalização 24 horas, devido ao alto grau de pressão sobre a UC em função de sua configuração geográfica (grande extensão, morfologia de arquipélago, hidrovia, proximidade com Manaus e Novo Airão e comunidades do entorno).
Entre as principais pressões estão a extração de madeira nas ilhas do arquipélago, a pesca comercial, a caça, o tráfico de animais silvestres e a atividade de mineração (areia). No combate aos ilícitos ambientais o parque conta com o apoio do Ibama, do Batalhão Ambiental da Polícia Militar do Amazonas, de fiscais do ICMBio lotados em outras unidades de conservação do País, entre outros parceiros.
